Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprtQ99M80 Smim24-201ENSMUST00000105322 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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PtprtQ99M80 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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PtprtQ99M80 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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PtprtQ99M80 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Zc2hc1a-203ENSMUST00000193010 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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PtprtQ99M80 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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PtprtQ99M80 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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PtprtQ99M80 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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PtprtQ99M80 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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PtprtQ99M80 Mir1190-201ENSMUST00000116925 96 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
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PtprtQ99M80 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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