Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

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Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Usp16Q99LG0 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Usp16Q99LG0 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Usp16Q99LG0 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Usp16Q99LG0 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Usp16Q99LG0 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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