Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR3

Lactb2, Endoribonuclease LACTB2, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lactb2Q99KR3 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lactb2Q99KR3 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lactb2Q99KR3 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lactb2Q99KR3 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lactb2Q99KR3 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lactb2Q99KR3 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Lactb2Q99KR3 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lactb2Q99KR3 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lactb2Q99KR3 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lactb2Q99KR3 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Lactb2Q99KR3 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lactb2Q99KR3 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lactb2Q99KR3 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lactb2Q99KR3 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Lactb2Q99KR3 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lactb2Q99KR3 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Lactb2Q99KR3 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Lactb2Q99KR3 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lactb2Q99KR3 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lactb2Q99KR3 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lactb2Q99KR3 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lactb2Q99KR3 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Lactb2Q99KR3 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Lactb2Q99KR3 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lactb2Q99KR3 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lactb2Q99KR3 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lactb2Q99KR3 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lactb2Q99KR3 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lactb2Q99KR3 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lactb2Q99KR3 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Lactb2Q99KR3 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lactb2Q99KR3 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lactb2Q99KR3 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lactb2Q99KR3 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lactb2Q99KR3 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lactb2Q99KR3 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lactb2Q99KR3 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lactb2Q99KR3 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lactb2Q99KR3 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lactb2Q99KR3 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lactb2Q99KR3 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lactb2Q99KR3 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lactb2Q99KR3 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lactb2Q99KR3 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lactb2Q99KR3 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lactb2Q99KR3 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lactb2Q99KR3 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lactb2Q99KR3 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lactb2Q99KR3 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lactb2Q99KR3 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lactb2Q99KR3 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Lactb2Q99KR3 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lactb2Q99KR3 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lactb2Q99KR3 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lactb2Q99KR3 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lactb2Q99KR3 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lactb2Q99KR3 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lactb2Q99KR3 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lactb2Q99KR3 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lactb2Q99KR3 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lactb2Q99KR3 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lactb2Q99KR3 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lactb2Q99KR3 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lactb2Q99KR3 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lactb2Q99KR3 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lactb2Q99KR3 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Lactb2Q99KR3 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Lactb2Q99KR3 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lactb2Q99KR3 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Lactb2Q99KR3 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lactb2Q99KR3 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lactb2Q99KR3 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lactb2Q99KR3 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lactb2Q99KR3 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Lactb2Q99KR3 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lactb2Q99KR3 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lactb2Q99KR3 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lactb2Q99KR3 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Lactb2Q99KR3 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Lactb2Q99KR3 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Lactb2Q99KR3 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Lactb2Q99KR3 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Lactb2Q99KR3 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lactb2Q99KR3 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lactb2Q99KR3 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lactb2Q99KR3 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Lactb2Q99KR3 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lactb2Q99KR3 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lactb2Q99KR3 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lactb2Q99KR3 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lactb2Q99KR3 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lactb2Q99KR3 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Lactb2Q99KR3 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lactb2Q99KR3 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lactb2Q99KR3 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lactb2Q99KR3 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lactb2Q99KR3 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lactb2Q99KR3 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lactb2Q99KR3 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lactb2Q99KR3 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.9 ms