Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.8 ms