Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Ctu1Q99J10 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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