Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
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Cldn16Q925N4 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
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Cldn16Q925N4 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
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Cldn16Q925N4 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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