Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Igsf1-203ENSMUST00000114891 1761 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11393-201ENSMUST00000118019 288 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr1310-201ENSMUST00000207169 1009 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 4930402F11Rik-201ENSMUST00000207348 1000 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10688-201ENSMUST00000214985 520 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm31763-201ENSMUST00000217788 673 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 AC132833.4-201ENSMUST00000228313 203 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Phyhipl-206ENSMUST00000162251 1540 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12697-201ENSMUST00000118008 667 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12731-201ENSMUST00000120932 268 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm38509-201ENSMUST00000197492 1150 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11320-201ENSMUST00000119434 463 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Sp3os-203ENSMUST00000137941 628 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26804-201ENSMUST00000181248 1017 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm29663-201ENSMUST00000186962 853 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm38047-201ENSMUST00000193690 1133 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr1335-202ENSMUST00000219094 1148 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 AC122840.3-201ENSMUST00000221474 486 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 mt-Nd1-201ENSMUST00000082392 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr1335-201ENSMUST00000084313 1148 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16794-203ENSMUST00000185324 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms