Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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