Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms