Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
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