Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
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Ssh3Q8K330 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
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Ssh3Q8K330 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Ssh3Q8K330 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
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Ssh3Q8K330 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
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Ssh3Q8K330 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Ssh3Q8K330 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Ssh3Q8K330 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Ssh3Q8K330 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Ssh3Q8K330 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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