Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms