Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFK2

Brf1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, mousemouse

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Length 676 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf1Q8CFK2 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Brf1Q8CFK2 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Brf1Q8CFK2 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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