Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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