Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef8Q8CE24 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef8Q8CE24 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef8Q8CE24 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef8Q8CE24 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef8Q8CE24 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef8Q8CE24 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef8Q8CE24 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef8Q8CE24 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef8Q8CE24 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef8Q8CE24 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef8Q8CE24 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef8Q8CE24 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef8Q8CE24 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef8Q8CE24 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef8Q8CE24 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef8Q8CE24 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef8Q8CE24 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef8Q8CE24 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef8Q8CE24 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef8Q8CE24 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef8Q8CE24 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef8Q8CE24 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef8Q8CE24 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef8Q8CE24 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef8Q8CE24 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef8Q8CE24 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Pramef8Q8CE24 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef8Q8CE24 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Pramef8Q8CE24 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef8Q8CE24 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef8Q8CE24 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef8Q8CE24 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef8Q8CE24 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Pramef8Q8CE24 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Pramef8Q8CE24 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef8Q8CE24 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef8Q8CE24 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef8Q8CE24 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef8Q8CE24 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef8Q8CE24 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef8Q8CE24 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef8Q8CE24 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef8Q8CE24 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef8Q8CE24 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pramef8Q8CE24 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pramef8Q8CE24 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pramef8Q8CE24 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pramef8Q8CE24 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pramef8Q8CE24 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pramef8Q8CE24 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pramef8Q8CE24 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pramef8Q8CE24 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pramef8Q8CE24 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pramef8Q8CE24 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pramef8Q8CE24 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Pramef8Q8CE24 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pramef8Q8CE24 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pramef8Q8CE24 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pramef8Q8CE24 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Pramef8Q8CE24 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Pramef8Q8CE24 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Pramef8Q8CE24 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Pramef8Q8CE24 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pramef8Q8CE24 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pramef8Q8CE24 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pramef8Q8CE24 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Pramef8Q8CE24 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pramef8Q8CE24 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pramef8Q8CE24 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pramef8Q8CE24 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pramef8Q8CE24 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pramef8Q8CE24 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pramef8Q8CE24 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pramef8Q8CE24 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pramef8Q8CE24 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pramef8Q8CE24 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pramef8Q8CE24 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Pramef8Q8CE24 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Pramef8Q8CE24 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pramef8Q8CE24 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pramef8Q8CE24 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms