Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Pla2g5-201ENSMUST00000030524 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms