Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Usp38Q8BW70 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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