Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Pggt1bQ8BUY9 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Pggt1bQ8BUY9 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Pggt1bQ8BUY9 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Pggt1bQ8BUY9 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Pggt1bQ8BUY9 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Pggt1bQ8BUY9 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
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Pggt1bQ8BUY9 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Pggt1bQ8BUY9 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Pggt1bQ8BUY9 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Pggt1bQ8BUY9 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Pggt1bQ8BUY9 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Pggt1bQ8BUY9 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Pggt1bQ8BUY9 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Pggt1bQ8BUY9 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms