Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
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Atg4dQ8BGV9 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
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Atg4dQ8BGV9 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg4dQ8BGV9 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg4dQ8BGV9 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Atg4dQ8BGV9 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg4dQ8BGV9 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Atg4dQ8BGV9 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Atg4dQ8BGV9 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Atg4dQ8BGV9 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg4dQ8BGV9 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Atg4dQ8BGV9 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Atg4dQ8BGV9 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg4dQ8BGV9 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg4dQ8BGV9 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg4dQ8BGV9 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg4dQ8BGV9 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg4dQ8BGV9 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg4dQ8BGV9 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg4dQ8BGV9 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg4dQ8BGV9 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg4dQ8BGV9 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg4dQ8BGV9 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg4dQ8BGV9 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg4dQ8BGV9 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg4dQ8BGV9 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg4dQ8BGV9 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg4dQ8BGV9 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg4dQ8BGV9 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
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