Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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ChfrQ810L3 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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ChfrQ810L3 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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ChfrQ810L3 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms