Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim19Q80ZU4 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
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