Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Ttc28Q80XJ3 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Ttc28Q80XJ3 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Ttc28Q80XJ3 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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