Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Zbed4Q80WQ9 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Zbed4Q80WQ9 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Zbed4Q80WQ9 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Zbed4Q80WQ9 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zbed4Q80WQ9 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90 ms