Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NischQ80TM9 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NischQ80TM9 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
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