Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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