Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

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Length 569 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shq1Q7TMX5 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms