Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Topbp1Q6ZQF0 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms