Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Ccdc88cQ6VGS5 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Ccdc88cQ6VGS5 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Ccdc88cQ6VGS5 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Ccdc88cQ6VGS5 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Ccdc88cQ6VGS5 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
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Ccdc88cQ6VGS5 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ccdc88cQ6VGS5 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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