Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Krt40Q6IFX3 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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