Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Nop58Q6DFW4 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Nop58Q6DFW4 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Nop58Q6DFW4 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nop58Q6DFW4 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms