Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZL1

Fgd6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd6Q69ZL1 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Gm23595-201ENSMUST00000104306 130 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Gm13827-201ENSMUST00000148801 372 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Mid1-ps1-201ENSMUST00000167967 1248 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Marc1-203ENSMUST00000189492 1239 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Isca2-206ENSMUST00000222449 374 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Tbc1d21-201ENSMUST00000040217 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fgd6Q69ZL1 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fgd6Q69ZL1 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fgd6Q69ZL1 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fgd6Q69ZL1 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Fgd6Q69ZL1 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fgd6Q69ZL1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fgd6Q69ZL1 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fgd6Q69ZL1 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Fgd6Q69ZL1 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fgd6Q69ZL1 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fgd6Q69ZL1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fgd6Q69ZL1 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fgd6Q69ZL1 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fgd6Q69ZL1 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fgd6Q69ZL1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fgd6Q69ZL1 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fgd6Q69ZL1 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fgd6Q69ZL1 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fgd6Q69ZL1 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Fgd6Q69ZL1 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fgd6Q69ZL1 Gm37207-201ENSMUST00000194284 296 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Fgd6Q69ZL1 Cdk5-203ENSMUST00000198990 783 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fgd6Q69ZL1 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fgd6Q69ZL1 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Fgd6Q69ZL1 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fgd6Q69ZL1 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fgd6Q69ZL1 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fgd6Q69ZL1 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fgd6Q69ZL1 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fgd6Q69ZL1 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fgd6Q69ZL1 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fgd6Q69ZL1 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fgd6Q69ZL1 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fgd6Q69ZL1 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fgd6Q69ZL1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fgd6Q69ZL1 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fgd6Q69ZL1 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fgd6Q69ZL1 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fgd6Q69ZL1 Nifk-202ENSMUST00000112688 849 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fgd6Q69ZL1 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Fgd6Q69ZL1 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fgd6Q69ZL1 Gm18010-201ENSMUST00000203553 202 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Fgd6Q69ZL1 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fgd6Q69ZL1 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Fgd6Q69ZL1 AC187103.3-201ENSMUST00000225725 646 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Fgd6Q69ZL1 AC174797.2-201ENSMUST00000225835 165 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Fgd6Q69ZL1 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Fgd6Q69ZL1 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fgd6Q69ZL1 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fgd6Q69ZL1 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fgd6Q69ZL1 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fgd6Q69ZL1 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fgd6Q69ZL1 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Fgd6Q69ZL1 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fgd6Q69ZL1 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fgd6Q69ZL1 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fgd6Q69ZL1 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fgd6Q69ZL1 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fgd6Q69ZL1 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fgd6Q69ZL1 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fgd6Q69ZL1 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fgd6Q69ZL1 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fgd6Q69ZL1 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fgd6Q69ZL1 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fgd6Q69ZL1 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fgd6Q69ZL1 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fgd6Q69ZL1 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Fgd6Q69ZL1 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fgd6Q69ZL1 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fgd6Q69ZL1 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fgd6Q69ZL1 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms