Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
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Pkp4Q68FH0 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Pkp4Q68FH0 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Pkp4Q68FH0 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Pkp4Q68FH0 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Pkp4Q68FH0 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Pkp4Q68FH0 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Pkp4Q68FH0 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Pkp4Q68FH0 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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