Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PtprdQ64487 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprdQ64487 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprdQ64487 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprdQ64487 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprdQ64487 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprdQ64487 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprdQ64487 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprdQ64487 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprdQ64487 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprdQ64487 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprdQ64487 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprdQ64487 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprdQ64487 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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PtprdQ64487 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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PtprdQ64487 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprdQ64487 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprdQ64487 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprdQ64487 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprdQ64487 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprdQ64487 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprdQ64487 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprdQ64487 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprdQ64487 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprdQ64487 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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PtprdQ64487 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprdQ64487 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprdQ64487 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprdQ64487 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprdQ64487 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprdQ64487 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprdQ64487 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprdQ64487 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprdQ64487 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprdQ64487 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprdQ64487 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprdQ64487 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprdQ64487 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprdQ64487 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprdQ64487 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprdQ64487 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprdQ64487 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprdQ64487 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprdQ64487 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
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