Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trim24Q64127 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms