Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

Predictions only

Length 3,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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AtmQ62388 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
AtmQ62388 AC153524.2-201ENSMUST00000218351 1375 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
AtmQ62388 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
AtmQ62388 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
AtmQ62388 Gm5395-201ENSMUST00000121650 915 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
AtmQ62388 Gm15982-201ENSMUST00000121681 554 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
AtmQ62388 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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AtmQ62388 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
AtmQ62388 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
AtmQ62388 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
AtmQ62388 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
AtmQ62388 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
AtmQ62388 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
AtmQ62388 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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AtmQ62388 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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AtmQ62388 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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AtmQ62388 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
AtmQ62388 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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AtmQ62388 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
AtmQ62388 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
AtmQ62388 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
AtmQ62388 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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AtmQ62388 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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AtmQ62388 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
AtmQ62388 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
AtmQ62388 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
AtmQ62388 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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AtmQ62388 Tipin-205ENSMUST00000216594 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
AtmQ62388 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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AtmQ62388 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
AtmQ62388 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
AtmQ62388 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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AtmQ62388 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
AtmQ62388 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
AtmQ62388 Ssty1-202ENSMUST00000186035 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
AtmQ62388 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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AtmQ62388 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
AtmQ62388 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
AtmQ62388 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
AtmQ62388 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
AtmQ62388 Gm21454-202ENSMUST00000192204 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
AtmQ62388 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
AtmQ62388 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
AtmQ62388 Gm20807-201ENSMUST00000194687 1336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
AtmQ62388 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
AtmQ62388 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
AtmQ62388 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms