Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

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Length 706 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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Mre11Q61216 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Mre11Q61216 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Mre11Q61216 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Mre11Q61216 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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Mre11Q61216 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Mre11Q61216 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Mre11Q61216 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Mre11Q61216 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Mre11Q61216 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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