Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms