Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
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Trappc1Q5NCF2 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Ighmbp2-201ENSMUST00000025751 3720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
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Trappc1Q5NCF2 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.01
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Trappc1Q5NCF2 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC8.71□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Nlgn3-201ENSMUST00000065858 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
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Trappc1Q5NCF2 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
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Trappc1Q5NCF2 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
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Trappc1Q5NCF2 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
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Trappc1Q5NCF2 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Epc1-201ENSMUST00000028100 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
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Trappc1Q5NCF2 Celsr3-201ENSMUST00000024238 11547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Lrrk1-201ENSMUST00000015277 7465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Nfya-202ENSMUST00000078800 3653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
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