Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms