Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Mir744-201ENSMUST00000103261 100 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Mrto4-ps2-201ENSMUST00000164169 549 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Mir3060-201ENSMUST00000175339 83 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Mir326-201ENSMUST00000083637 95 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shank3Q4ACU6 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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