Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Pigp-201ENSMUST00000113905 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Lrrc43Q3V0L5 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Lrrc43Q3V0L5 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Olfr829-201ENSMUST00000058411 966 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Lrrc43Q3V0L5 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrrc43Q3V0L5 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrrc43Q3V0L5 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Lrrc43Q3V0L5 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrrc43Q3V0L5 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrrc43Q3V0L5 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrrc43Q3V0L5 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Lrrc43Q3V0L5 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc43Q3V0L5 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Lrrc43Q3V0L5 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc43Q3V0L5 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc43Q3V0L5 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Lrrc43Q3V0L5 Slc25a21-202ENSMUST00000110680 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Lrrc43Q3V0L5 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Lrrc43Q3V0L5 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc43Q3V0L5 Olfr725-201ENSMUST00000089844 1110 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc43Q3V0L5 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc43Q3V0L5 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc43Q3V0L5 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc43Q3V0L5 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc43Q3V0L5 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc43Q3V0L5 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc43Q3V0L5 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc43Q3V0L5 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc43Q3V0L5 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc43Q3V0L5 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc43Q3V0L5 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc43Q3V0L5 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc43Q3V0L5 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc43Q3V0L5 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Lrrc43Q3V0L5 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc43Q3V0L5 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc43Q3V0L5 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc43Q3V0L5 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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