Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc27Q3V036 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms