Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXB0

Mbd3l2, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3l2Q3UXB0 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Anxa6-202ENSMUST00000108883 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Gm28581-201ENSMUST00000186086 2177 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms