Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3UPC7 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3UPC7 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3UPC7 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3UPC7 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3UPC7 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3UPC7 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3UPC7 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3UPC7 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3UPC7 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3UPC7 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3UPC7 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3UPC7 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3UPC7 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3UPC7 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3UPC7 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3UPC7 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3UPC7 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms