Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms