Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Gm15929-201ENSMUST00000138926 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Gm29747-201ENSMUST00000194764 585 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Gm45276-201ENSMUST00000209549 1086 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc34Q3UI66 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Olfr967-202ENSMUST00000213358 1210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Rad51c-202ENSMUST00000067692 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms