Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trafd1Q3UDK1 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms