Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms