Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms