Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms